Desenvolvimento de um software para o gerenciamento e integração

# Desenvolvimento de um software para o gerenciamento e integração
## de dados de proteômica
### Discente: Elizabeth Alfaro-Espinoza
### Orientador: Sérgio Aguiar Vale Campos
### Co-orientadora: Alessandra Conceição Faria Campos

---

layout: true
  
<div class="my-footer"><span>
Seminários em Bioinformática <a href="https://seminarios-fluxprt.netlify.app/">27/06/2022</a> - <a href="https://github.com/ElizaAlfaro">Elizabeth Alfaro-Espinoza</a>
</span></div>

---
class: middle

---
class: middle

---
class: middle

---
class: middle

# LIMS
⛔ Papelada

⛔ Custo tempo

🔍 Resultados

🔍 Amostras

👉 Relatórios

🎯 Trabalho do lab

<img src="visual_citations/Higgins_2022.png" width="100%" style="display: block; margin: auto auto auto 0;" />
]

.right-column[ 
<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/intro/limsUsers.svg" alt="Adaptado de Higgins, Nogiwa-Valdez e Stevens (2022). " width="80%" />
<p class="caption">Adaptado de Higgins, Nogiwa-Valdez e Stevens (2022). </p>
</div>
]

---
class: middle

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/intro/fluxprt.png" alt="Integração de ferramentas e métodos de proteómica em um sistema." width="90%" />
<p class="caption">Integração de ferramentas e métodos de proteómica em um sistema.</p>
</div>

---
class: middle

# Objetivos Específicos
<br>

### <center>FluxPRT: <i>"Integração de ferramentas e métodos de proteómica em um sistema"</i><br><br></center>

.pull-right[
*Fonte: <a href="https://www.flaticon.com/free-icons/share" title="share icons">Freepik - Flaticon</a>. Licença CC Atrib.*
]

---
class: middle

# Desenvolvimento do FluxPRT

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/metod/metodologia.svg" alt="&lt;i&gt;Fluxo do desenvolvimento do sistema. Fonte: Autoral, usando icones do Freepik - Flaticon.&lt;/i&gt;" width="90%" />
<p class="caption"><i>Fluxo do desenvolvimento do sistema. Fonte: Autoral, usando icones do Freepik - Flaticon.</i></p>
</div>

---
class: middle

# Especificação
<center><br><h4>Atividade: Conjunto de atributos. Pode ter conexões de precedência.</h4><br></center>

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/metod/especifica.svg" alt="&lt;i&gt;Especificação da versão atual. Fonte: Autoral.&lt;/i&gt;" width="70%" />
<p class="caption"><i>Especificação da versão atual. Fonte: Autoral.</i></p>
</div>

---
class: middle

# Protótipo dev

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/metod/prototipo.png" alt="&lt;i&gt;Versão atual do FluxPRT. Fonte: Autoral.&lt;/i&gt;" width="100%" />
<p class="caption"><i>Versão atual do FluxPRT. Fonte: Autoral.</i></p>
</div>

---
class: middle

```
--- http://www.flux2.luar.dcc.ufmg.br
--- guest2021: gu3st
```

---
class: middle

## Documentação

📌  Específ. do FluxPRT

```
--- https://fluxprt.github.io
```
]

.right-column[ 
<img src="img/result/documentacao.gif" width="96%" style="display: block; margin: auto 0 auto auto;" />
]

---
class: middle
## Documentação específica do FluxPRT

<div class="shareagain" style="min-width:300px;margin:1em auto;">
<iframe src="https://fluxprt.github.io" width="1600" height="700" style="border:2px solid currentColor;" loading="lazy" allowfullscreen></iframe>
<script>fitvids('.shareagain', {players: 'iframe'});</script>
</div>

---
class: middle

## Diferentes enfoques de trabalho

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/result/labApproach.png" alt="&lt;center&gt;&lt;i&gt;Interação entre o sistema Flux e o Guia Interativo. Fonte: Alfaro-Espinoza et. al. (2021).&lt;/i&gt;&lt;/center&gt;" width="100%" />
<p class="caption"><center><i>Interação entre o sistema Flux e o Guia Interativo. Fonte: Alfaro-Espinoza et. al. (2021).</i></center></p>
</div>

---
class: middle

# Testes
<center><iframe width="940" height="450" src="https://www.youtube.com/embed/2lwmWPjRnDk?start=8" frameborder="0" allow="accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture" allowfullscreen></iframe></center>

---
class: middle

# Feedback

<center><br><h4>Moficações nas atividades e atributos</h4><br><br></center>

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/result/fluxoAtivbrModif.png" alt="&lt;center&gt;&lt;i&gt;Atividades do FluxPRT. Fonte: Autoral.&lt;/i&gt;&lt;/center&gt;" width="100%" />
<p class="caption"><center><i>Atividades do FluxPRT. Fonte: Autoral.</i></center></p>
</div>

---
class: middle

# Feedback incorporado

<center><br><h4>15 atividades</h4><br><br><br></center>

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/result/fluxoAtivTestes.svg" alt="&lt;center&gt;&lt;i&gt;Atividades do FluxPRT. Fonte: Autoral.&lt;/i&gt;&lt;/center&gt;" width="100%" />
<p class="caption"><center><i>Atividades do FluxPRT. Fonte: Autoral.</i></center></p>
</div>

---
class: middle

# Relatório

<div class="figure" style="text-align: center">
<img src="img/result/relatorio.png" alt="Relatório da atividade de Obtenção. Fonte: Autoral." width="90%" />
<p class="caption">Relatório da atividade de Obtenção. Fonte: Autoral.</p>
</div>

---
class: middle

# FluxPRT
<br>

.pull-right[
*Fonte: <a href="https://www.flaticon.com/free-icons/share" title="share icons">Freepik - Flaticon</a>. Licença CC Atrib.*
]

---

# Próximos Passos

<br>

.pull-right[
*Fonte: <a href="https://www.flaticon.com/free-icons/share" title="share icons">Freepik - Flaticon</a>. Licença CC Atrib.*
]

---

# ¡Muito obrigada!
.pull-left[

<img src="img/thanks.png" width="100%" style="display: block; margin: auto;" />
]

.pull-right[
**Agradecimientos especiais**:
- Sérgio Campos.
- Alessandra Campos
- Equipe LUAR
- Membros LPBP - UFV
- Secretaria do PPG Bioinformática
- Bolsa CAPES 88887.517813/2020-00
]

**Contato**:
- Email: <a href="mailto:elizaespinoza@ufmg.br">elizaespinoza@ufmg.br</a>
- Github: <a href="https://github.com/ElizaAlfaro">@elizaAlfaro</a>
- Twitter: <a href="http://twitter.com/elizabioinfo">@elizabioinfo</a>

.pull-right[
#####Feito com 💙 usando [Xaringan](https://github.com/yihui/xaringan) e [XaringanExtra](https://github.com/gadenbuie/xaringanExtra).
]

---
class: inverse, middle

#Equipe LUAR

---
class: middle
## Referências